شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با صفات تولیدمثلی در گوسفند بلوچی با استفاده از نشانگرهای با تراکم بالا

Authors

  • لوکا فونتانزی عضو هیات علمی بخش ژنتیک و اصلاح نژاد دام، دانشگاه بلونیا ایتالیا
  • مجید پسندیده دانش‏ آموخته دکتری تخصصی ژنتیک و اصلاح نژاد دام، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
  • محسن قلی زاده استادیار بخش ژنتیک و اصلاح نژاد دام، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
Abstract:

در این تحقیق، یک پویش ژنومی برای شناسایی جایگاه‏های مؤثر بر صفات تولیدمثلی در گوسفند بلوچی انجام شد. به این منظور، نمونه‏برداری خون از 96 رأس میش همراه با داده‏های فنوتیپی مربوط به صفات تولیدمثلی شامل مجموع وزن همزادان متولد شده، میانگین وزن همزادان در تولد، مجموع وزن همزادان شیرگیری شده، میانگین وزن همزادان شیرگیری شده و تعداد بره‏های زنده در شش ماهگی  در چهار نوبت زایش بدست آورده شد. پس از استخراج DNA، نمونه‏ها با استفاده از تراشه‏هایSNP  گوسفندی (50K) تعیین ژنوتیپ شدند. تجزیه مطالعه ارتباط ژنومی با استفاده از نرم­افزار PLINK در مدل‏های رگرسیون خطی و لجستیک شامل اثرات SNP‏ها و عوامل ثابت جنس و نوبت زایش انجام شد. در مجموع، هشت نشانگر معنی‏دار در سطح کروموزومی روی کروموزوم‏های 1، 4، 10، 15 و 17 مرتبط با صفات تولیدمثلی مورد مطالعه شناسایی شد (05/0>P). بررسی ژن‏ها و QTL‏ها در این مناطق نیز نشان‏دهنده وجود ژن‏ها و QTLهای مؤثر بر صفات رشد و تولیدمثلی بود. از نتایج این تحقیق می‏توان برای کشف واریانت‏های مسبب صفات تولیدمثلی در برنامه‏های اصلاح نژادی گوسفند استفاده نمود.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

full text

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

full text

شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با قطر پشم در نژادهای گوسفند ایرانی

هدف از این پژوهش پویش ژنوم گوسفند برای شناسایی جایگاه‌های مؤثر بر قطر پشم در نژادهای بومی کشور بود. برای این منظور نمونه‌های خون 94 حیوان، شامل 47 رأس از نژاد ایرانی زل و 47 رأس از نژاد ایرانی لری‌بختیاری تهیه شد و پس از استخراج DNA، نمونه‌ها با استفاده از آرایه‌های Ovine 50k SNP Chip تعیین ژنوتیپ شدند. داده‌های حاصل به منظور بررسی کیفی آنالیز شدند. پس از این مراحل، در نهایت مجموع 48056 نشانگر ...

full text

شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با قطر پشم در نژادهای گوسفند ایرانی

هدف از این پژوهش پویش ژنوم گوسفند برای شناسایی جایگاه های مؤثر بر قطر پشم در نژادهای بومی کشور بود. برای این منظور نمونه های خون 94 حیوان، شامل 47 رأس از نژاد ایرانی زل و 47 رأس از نژاد ایرانی لری بختیاری تهیه شد و پس از استخراج dna، نمونه ها با استفاده از آرایه های ovine 50k snp chip تعیین ژنوتیپ شدند. داده های حاصل به منظور بررسی کیفی آنالیز شدند. پس از این مراحل، در نهایت مجموع 48056 نشانگر ...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت گوسفند بلوچی با استفاده از نشانگرهای ریز ماهواره

In order to identify polymorphic microsatellite markers and evaluae genetic variation within Baluchi sheep population, nineteen microsatellite loci were studied. Whole Blood samples were collected from 156 sheep at north eastern animal breeding station of Iran (Abbasabad-Mashhad). DNA was extracted by salting-out procedure with some modifications. Polymerase chain reactions were successfully do...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت گوسفند بلوچی با استفاده از نشانگرهای ریز ماهواره

In order to identify polymorphic microsatellite markers and evaluae genetic variation within Baluchi sheep population, nineteen microsatellite loci were studied. Whole Blood samples were collected from 156 sheep at north eastern animal breeding station of Iran (Abbasabad-Mashhad). DNA was extracted by salting-out procedure with some modifications. Polymerase chain reactions were successfully do...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 6  issue 3

pages  29- 41

publication date 2017-11-22

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023